三一国际礼拜堂原名“三一圣堂”。始建于1904年，老教堂位于昆明市原武成路218号，建成后成为云南省基督教“内地会”活动中心，临街为礼拜堂，后院为教牧人员住房。礼拜堂临街为三层小楼，一楼为过道，二楼为两间办公室和能容纳几十人的聚会所，三楼为办公室。教堂主堂能容纳五百人礼拜。1963年，云南省基督教三自爱国运动委员会成立，办公地点就设在三一圣堂。1984年12月，“三一圣堂”恢复礼拜。1986年成为云南省基督教“两会”的办公所在地。1997年2月，因昆明城市建设拓宽道路需要，“三一圣堂”被拆除。

新教堂综合楼于2003年6月22日举行了奠基典礼，并宣布：经省人民政府宗教事务局批准，更名为“三一国际礼拜堂”。于2004年12月12日举行了献堂感恩礼拜。新教堂位于人民中路188号，占地约1.8亩，建筑面积4018平方，每主日分五堂崇拜，7000余人次参加。现有专职教牧同工19人，其中牧师6人，传道6人，行政同工7人，另有执事95人，其他义工300多位，省两会部分牧师、传道参与本堂证道侍奉。

主日除了5次大礼拜之外，为满足不同群体信徒的需要，在礼拜间的白天、晚上分别开设了20多个团契的聚会（小组活动），可以说，几乎每天，都有3-4个团契在教堂聚会，大到二、三百人，小到几十人的小组聚会。

三一堂还特别针对弱势群体建立了“天使团契”、“聋友团契”和“心光盲人团契”，人数150人左右。在这些团契里，没有一个肢体完全、身体健康的人，他们或双目失明，或下肢瘫痪，或智障，或脑瘫，或唐氏儿……这样一个群体，在三一堂的爱心关怀下进行康复训练，并快乐的生活着，在教会这个大家庭中找到了尊严，享受着主恩主爱所带来的平安喜乐。

三一国际礼拜堂在内部管理上取得了长足的发展，2010年12月，三一堂获得了中央统战部、国家宗教事务局颁发的“首届全国创建和谐音寺观教堂”先进集体。主任牧师靖玖玮荣获2011年云南省首届和谐寺观教堂先进个人，并多次获得盘龙区政协先进个人、统一战线先进个人。三一堂多次获得五华区政府授予的“绿化先进单位”、“消防工作先进单位”、“维护稳定先进单位”、“治安先进单位”一系列殊荣。

三一国际礼拜堂为省基督教两会直管教堂。